Le transport fluvial de marchandises ne connaît pas la crise. Malgré un contexte plutôt difficile, la fréquentation de la Seine dans ce secteur progresse encore, selon les chiffres de 2012 : +0,6%.
C'est en matière de transport de conteneurs que la hausse est la plus nette, avec une hausse de près de 6%. Il se place en troisième position derrière les matériaux de construction et bien sûr les céréales.
Plus de deux millions de tonnes de conteneurs aujourd'hui, c'est un beau résultat quand on sait que ce transport n'existait pas sur la seine avant 1994. Ce développement est en partie lié à de récentes initiatives, comme en région parisienne l'approvisionnement des magasins Franprix via la Seine, ou la livraison de colis organisée par "vert chez Vous".
A l'inverse, les transports de produits agricoles sont en baisse, continue depuis le record d'exportations de 2010.