Il a été élu maire en 1977, dans quelques jours l'actuel président de la région ne sera plus un élu du conseil municipal, retour sur la liaison Auxiette, La Roche en une vidéo.
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D'abord militant de l'UNEF, Jacques Auxiette débute sa carrière politique à La Roche-sur-Yon en 1970 en entrant au PSU. En 1973 il adhère au PS et devient secrétaire de la section de La Roche-sur-Yon. Il accède en 1986 au poste de premier secrétaire fédéral pour la Vendée, poste qu'il occupera jusqu'en 1990. En parallèle, il assume un engagement syndical au Syndicat national des enseignements de second degré, mutualiste à la MGEN, et dans l'éducation populaire au sein de la Fédération des Œuvres Laïques de Vendée.En 1977, il est élu maire de La Roche-sur-Yon, à la tête d'une liste de la gauche unie. De 1979 à 1985, il est conseiller général du canton nord de La Roche-sur-Yon.
Il siège au conseil régional des Pays de la Loire à partir de 1979, et conserve son mandat de maire jusqu'en 2004, année où il emporte la présidence de la région face à François Fillon. Il laisse alors sa place de maire à Pierre Regnault, tout en restant conseiller municipal. Au second tour des élections régionales françaises de 2010, il est réélu avec 56,39 % des voix contre 43,61 % pour la liste UMP conduite par Christophe Béchu.
Jacques Auxiette a également été administrateur de l'ENA (1983-1987) et président du GART (1989-2001).
Son ultime conseil municipal