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Les secrets du génome du chêne enfin révélés

© CC by wikimedia
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Les scientifiques bordelais de l'INRA en partenariat avec le Centre National de Séquençage du CEA viennent de finir de décrypter le génome du chêne pédonculé. Le Quercus robur est l'arbre le plus emblématique connu ici pour ses barrique et autour duquel on trouve parfois de savoureux champignons...

Par CB

Dans un communiqué, l'Inra explique qu'il s'agit du premier séquençage pour une espèce du genre Quercus très largement répandu dans l’hémisphère nord. 
Trois années de travaux ont été nécessaires à ce consortium piloté par l’Inra de Bordeaux-Aquitaine, en partenariat avec le Centre National le Séquençage du CEA (Génoscope), pour décrypter l'ensemble de l'information génétique portée par ses 12 paires de chromosomes.
"Le consortium a caractérisé 50 000 gènes et estimé que la moitié des 1,5 milliard de paires de base du génome était constituée d’éléments répétés".  

A quoi ça sert ?

Ces travaux "permettront notamment de mieux comprendre les mécanismes d’adaptation des arbres aux variations environnementales et fourniront des éléments pour anticiper leurs réponses au changement climatique". 
Car le chêne pédonculé (Quercus robur) fait partie de la section botanique la plus importante du genre Quercus : les chênes blancs, dont on dénombre 200 espèces et qui sont présents à la fois en Europe, en Asie et en Amérique. 

Ce séquençage aura "ainsi valeur de référence pour les autres espèces de chênes blancs, mais également pour des espèces plus éloignées de la famille des Fagacées" (Châtaignier ou Hêtre).

Il permettra
  • d’étudier la régulation interne des espèces très longévives exposées à de forte variations climatiques annuelles, voire à des événements extrêmes au cours de leur vie.
  • d'identifier les gènes impliqués dans l'adaptation à l'environnement ou dans les relations symbiotiques entre leurs racines et les champignons mycorhiziens (comme le mycélium de la truffe).
  • identifier les gènes responsables de la biosynthèse des extractibles du bois, tels que les tannins et whisky lactone, qui confèrent leur saveur et leur goût aux vins et alcools.

Une avancée majeure

SElon les chercheurs de l'INRA : "Ces travaux constituent une avancée majeure dans la connaissance de la biologie, de la génétique et de l’évolution des arbres, qui sera largement valorisée dans les recherches à venir portant sur la structure et le fonctionnement du génome de ces espèces pérennes. Au-delà de la connaissance académique, ces recherches ouvrent des perspectives dans des domaines plus appliqués, en réponse aux multiples questions sociétales portant sur l’évolution des forêts".

Des résultats partagés
Conformément aux accords internationaux, les données du séquençage du génome du chêne sont mises librement à disposition de la communauté scientifique (www.oakgenome.fr), avant la publication de l’article scientifique finalisé par le consortium prévue dans les prochains mois.


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