Pour la maintenance des équipements de sécurité des tunnels, la voie des Mercureaux est fermée dans les deux sens en journée.
Des déviations sont mises en place par la Nationale 83 (Côte de Larnod) et la route départementale 104. Elles sont indiquées par le numéro S7 dans le sens Pontarlier vers Besançon et S4 dans le sens Besançon vers Pontarlier.
