Le Ter qui effectue la liaison entre Laroche-Migennes dans l'Yonne et Dijon en Côte d'Or a été stoppé en gare de Tonnerre dimanche 7 avril 2013, vers 20h. Les passagers ont dû changer de train, ce qui a occasionné environ deux heures de retard.
C'est une fin de week-end mouvementée qu'ont vécue ces usagers du TER Bourgogne. Un valise suspecte, vraisemblablement oubliée par un client, a été découverte par un contrôleur qui a alerté la police, dans le cadre du plan Vigipirate, Le train express régional s'est arrêté en gare de Tonnerre. Les passagers ont dû descendre du TER. Au total, 320 voyageurs ont été évacués du train. Ils ont attendu dans un gymnase avant de prendre un autre train pour Dijon. La gare a aussi été évacuée.
Quant au TER, il est en transit pour la gare de Laumes en Côte d'Or, où les services de déminage vont intervenir, ont indiqué les pompiers vers 22h.